Introducción a la Bioinformática
Este curso consta de 6 masterclass pregrabadas y una duración aproximada de 2 semanas.
Clase 1.-Técnicas de secuenciación y Proyectos genoma.
Clase 2.- Bases de datos de nucleótidosGenBank/EMBL/DDBJ.Bases de datos de proteínas Pfam/SwissProt/PDB.Búsqueda de secuencias en bases de datos, Números de acceso.
Clase 3.- Alineamiento múltiple de secuencias Clustal W, Algoritmo BLAST, Algoritmo FASTA. Formatos y edición de secuencias Programa BIOEDIT. Predicción de genes, marcos abiertos de lectura.
Clase 4. - Mapas de restricción de secuencias.Diseño de cebadores (Primers) para la amplificación de secuencias
Clase 5. - Determinación de la estructura secundaria de las proteínas programa PSIPRED.Identificación de secuencias consenso para modificaciones postraduccionales, ExPASy-SIB y Motifscan- ISREC.Predicción de motivos y dominios funcionales CDD-Search-NCBI, Interpro-EMBL.
Clase 6. - Resolución de problemas de análisis básicos de secuencias.